エントリーシート提出後、さらに良い自己PRを思いついたのであれば、新しい内容を伝えることに問題はないと思います。ただし、その内容が以前記入したものから大きく異なる内容になってしまうのであれば問題ですので、注意しましょう。また、なぜ自己PRが変わったのかを採用担当者に聞かれる可能性もありますので、その準備もしておきましょう。